0
Давайте уточним конфигурацию программы. ))) 
0
1. О какой конфигурации программ 1С идёт речь?
2. Что такое «Документы по выплате зарплаты»: отчет или какой-то журнал?
Можно чуть больше информации? )))  
+1
Глядя на программный код обработки, могу сказать, что ошибка возникает если вы неправильно указали номер счета в базе 1С. Т.е. обработка берет номер счета из файла и сранивает её со счетом из базы. Проверьте внимательно.
0
Хотя бы кусочек файла txt можно увидеть? Если секрет, то в личку. И, насколько я понял вы про бухгалтерию говорите?